يشرف على هذا القسم عدد من الاخصائيين و الجراحين في جراحه المسالك البولية و التناسلية و العقم  و يقدم القسم الخدمات الاتية :-

1- الكشف على جميع امراض المسالك البولية بواسطة أحدث الاجهزه الطبية المتطورة مثل اجهزة الكشف بالموجات فوق الصوتية و مناظير المسالك البولية المختلفة التشخيصية التالية :

*مناظير المثانة للكبار و الصغار و حديثي السن .

*مناظير الحالب للكبار والصغار و حديثي السن .

*مناظير الكلى للكبار و الصغار و حديثي السن .

2- اجراء جميع أنواع العمليات و الجراحية الخاصة بالمسالك البولية المفتوحة كجراحة استئصال حصولت الكى و الحالب و المثانة و استئصال البروستاتا و استئصال اورام المسالك البولية عند الاطفال كالعيوب الخلقية في الخصية المعلقة و عيوب مجرى البول و الحالب و المثانة البولية ..

3- جراحة المناظير بأنواعها و تتمثل بما يلي:

*استئصال البروستاتا .

*استئصال مجرى البول .

*تفتيت  حصو المثانة .

*تفتيت حصو الحالب .

*تفتيت حصو الكلى .

*استئصال اورام المثانة .

4- تفتيت الحصوات بجهاز الموجات التصادمية بدون جراحة او تخدير او الام .

5- تفتيت حصوات الكلى و المسالك البولية باليزر .

6- استئصال البروستات و اورام المسالك البولية باليزر .

7- معالجة الاضطرابات الجنسية و العقم .

8- معالجة و جراحة السلس البولي اللاارادي.

جهاز تفتيت الحصوات

ولأهمية توفير جهاز تفتيت الحصوات ..و نظرا لكثير مرضى الكلى في اليمن فقد قام المستشفى بتوفير احدث الاجهزة منها جهاز تفتيت الحصوات بالموجات التصادمية بدون عمليات جراحية وبأسعار زهيدة جدا لتكون ميسره لجميع المرضى .

جهاز تفتيت الحصوات يقوم بتحديد مكان الحصى وحجمها ومن ثم العمل على تفتيتها بدون تخدير او جراحة او الام .و مغادرة المرض المستشفى بعد جلسة التفتيت وهذا ما يطمح الية الكثيرمن مرضى المسالك البولية بعيدا عن جراحة المشارط ةما ينتج عنها من الام .

وكما يتم اجراء العمليات المسالك البولية بواسطة جهاز أشعة الليزر أحدث جهاز متوفر في مستشفى المتوكل و الذي ينفرد به المستشفى بمميزاتة المذهلة اوأهمها:

* استئصال كامل البروستات دون الحاجة إلى نقل دم و بدون اي مضاعفات تذكر مع إمكانية خروج المريض من المستشفى بالصحة و العافية في اليوم التالي بعد العملية و العودة إلى ممارسة أعمالة المختلفة .

*استئصال التضيقات في جميع أجزاء مجاري المسالك البولية .

*استئصال الأورام في البروستات و المثانة و الحالب .

*تفتيت حصوات المثانة و الحالب و الكلى بجلسة واحدة .

*إجراء عمليات أخرى معقدة بواسطة هذا الجهاز.